Efficacy of an information system addressed to nursing staff for diminishing contaminated blood cultures: a blind clinical trial / Eficacia de un sistema de información dirigido al personal de enfermería para disminuir la contaminación de los hemocultivos: un ensayo clínico ciego

Introduction: Evaluate the efficacy of an information system addressed to nursing staff to lower the blood culture contamination rate. Methods: A blind clinical trial was conducted at Internal Medicine and Emergency Departments during 2011. After following a reeducation program in BC extraction, participants were randomly selected in a 1:1 ratio. Every participant of the experimental group was informed of each worker's individual performance; whereas the control group was only informed of the global results. Results: A total of 977 blood extractions were performed in 12 months. Blood culture contamination rate was 7.5%. This rate was higher in the Emergency Department than in Internal Medicine (10% vs. 3.8%; p=0.001). Factors associated with the higher risk of contamination were, in the univariate analysis, the extraction through a recently implanted blood route and the time of professional experience, while those associated with a lower risk were the extraction in Internal Medicine and through a butterfly needle. On multivariate analysis, extraction through a recently placed access was an independent risk factor for an increased contamination rate (OR 2.29; 95%CI 1.18-4.44, p=0.014), while individual information about the blood culture results (OR 0.11; 95%CI 0.023-0.57; p=0.008), and more than 9 years of professional experience were asso-ciated with fewer contaminations (OR 0.30; 95%CI 0.12-0.77; p=0.012). In the intervention group the contamination rate diminished by a 26 %. Conclusions: Drawing blood cultures through a recently taken peripheral venous access increased their risk of contamination. The intervention informing the nurse staff of the contamination rate is effective to decrease it

Objetivos: Evaluar la eficacia de un sistema de información dirigido al personal de enfermería, en la reducción de la tasa de contaminación de los hemocultivos. Métodos: Durante el año 2011, se realizó un ensayo clínico en los servicios de Medicina Interna y de Urgencias. Después de seguir un programa de reeducación en la extracción de los hemocultivos, los participantes, fueron aleatorizados en una proporción de 1:1. En el grupo de intervención se informó del porcentaje de hemocultivos contaminados de cada profesional y en el grupo control se aportaba la información del porcentaje global de contaminaciones. Resultados: Durante un periodo de 12 meses se realizaron 977 extracciones. La tasa de contaminación de los hemocultivos fue del 7,5%. Esta tasa fue mayor en Urgencias que en Medicina Interna (10% versus 3,8%, p=0,001). Los factores asociados con mayor riesgo de contaminación fueron, en el análisis univariable: la extracción a través de una vía sanguínea recientemente implantada y el tiempo de experiencia profesional; mientras que los que se asociaron con menor riesgo fueron la extracción en Medicina Interna (versus en Urgencias) y a través de una palomilla. En el análisis multivariable, la extracción de los hemocultivos de una vía recientemente implantada se relacionó de forma independiente con un incremento de las contaminaciones (OR 2,29, IC 95% 1,18-4,44, p=0,014),mientras que la información individual sobre los resultados de los hemocultivos (OR 0.11; IC 95% 0,023-0,57; p=0,008) y la experiencia profesional mayor de 9 años, lo hizo con menos contaminaciones (OR 0,30, IC 95% 0,12-0,77, p=0,012). En el grupo de intervención la tasa de contaminaciones se redujo en un 26%. Conclusión: La extracción de hemocultivos a través de una vena periférica recientemente implantada aumentó el riesgo de contaminación de los mismos. La intervención informativa a los enfermeros de la tasa de contaminación de los hemocultivos, es eficaz para disminuirla

Recomendaciones para la optimización del uso de marcadores tumorales de utilización frecuente. Recomendación (2018) / Recommendations for the optimization of the use of frequently used tumor markers. Recommendation 2018

Este documento describe las causas de error más frecuentes en la medición de marcadores tumorales séricos proteicos en sus diferentes fases: preanalítica, analítica y postanalítica y recomendaciones para detectar y solventar problemas, así como la interpretación de los resultados de los marcadores tumorales en la práctica clínica

This document describes the most frequent causes of error in the measurement of 13 serum protein tumour markers in their different phases: preanalytical, analytical and 14 postanalytic and recommendations to detect and solve problems, as well as the 15 interpretation of the results of the Tumor Markers in clinical practice

Estabilidad de analitos conservados en tubo cerrado con film versus cerrado con tapa plástica / Stability of analytes stored in a tube sealed with film versus closed with plastic cap

Introducción: El laboratorio debe garantizar la estabilidad de las muestras conservadas con la finalidad de una eventual confirmación de resultados o corregir posibles errores u omisiones al ingresar las solicitudes médicas. Con este objetivo se comparó la estabilidad de los analitos de muestras conservadas en el tubo primario selladas con film contra cierre con tapa plástica. Material y métodos: Veinticuatro muestras de sangre fueron alicuotadas en dos tubos primarios, uno cerrado con tapa plástica y otro con film. A ambas alícuotas se les midieron 26 analitos de química clínica durante siete días consecutivos, en un autoanalizador Cobas c 501 de Roche y se conservaron en refrigerador a 2-8°C. Se calcularon los coeficientes de variación y el error total. Los resultados obtenidos se compararon con el requisito de calidad respectivo establecido por el laboratorio. Conclusiones: Se observó una mayor variabilidad en los tubos cerrados con film respecto de los cerrados con tapa plástica. Todas las enzimas evaluadas cumplieron el requisito de calidad durante 4 días. A excepción del hierro todos los iones fueron estables solo un día. Los metabolitos fueron estables durante una semana a excepción de glucosa, proteínas totales, ácido úrico y albúmina. Se recomienda que cada laboratorio evalúe la estabilidad de los analitos en base a su forma de trabajo

Introduction: The laboratory must be able to guarantee the stability of stored patient samples for confirmation of results or errors in the interpretation of the medical request. The aim of this study was to evaluate the stability of the blood analytes preserved in tubes sealed with film versus a plastic cap. Material and methods: A total of 24 blood samples were aliquoted into two tubes; one sealed with film, and the other with a plastic cap. Twenty-six clinical chemistry analytes were measured for 7 consecutive days using a Roche Cobas c 501 autoanalyser. The samples were stored in a refrigerator between 2-8C. The total error and coefficient of variation were calculated, and the results were compared against the quality requirements of the laboratory. Conclusions: The variation was higher in the tubes sealed with film than in those with a plastic cap. Enzymes remained within the quality requirements for four days, and ions, apart from iron, were stable for only one day. The metabolites were stable for seven days excluding glucose, uric acid, total proteins, and albumin. It is suggested that each laboratory must evaluate the stability of analytes based on its workflow

Desarrollo de procedimientos de medida basados en la cromatografía líquida de alta resolución / Development of measurement procedures based on high-performance liquid chromatography

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Procedimiento para el estudio de interferencias exógenas en la medición de magnitudes biológicas. Documento técnico (2017) / Procedure for the study of exogenous interferences in the measurement of biological quantities. Technical document (2017)

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Qualificação do transporte de amostras para o monitoramento da qualidade de água tratada para uso em diálise / Qualification of the sample transport for monitoring the quality of water for dialysis purpose

As condições de coleta e o transporte das amostras de água tratada para uso em diálise são etapas críticas para garantir a qualidade dos resultados analíticos. A temperatura no transporte de amostras deve assegurar a manutenção das características físicas e biológicas desde a coleta até o recebimento pelo laboratório analítico. O objetivo deste estudo foi de qualificar o transporte de amostras de água tratada para diálise desde os Serviços de Diálise do estado de São Paulo até o Instituto Adolfo Lutz, realizado durante a execução do Programa Estadual de Monitoramento. Os resultados obtidos indicaram que o sistema adotado, utilizando-se caixas isotérmicas e gelo reutilizável, é capaz de garantir as condições adequadas de temperatura durante o transporte do ponto de coleta das amostras até o laboratório analítico.

The conditions for collecting and transporting the dialysis water samples are the critical steps to assure the quality of the analytical results. The temperature during the water samples transport should ensure the maintenance of the physical and biological characteristics of samples from their collections to the analytical laboratory. The objective of this study was to qualify the transport of the dialysis water samples from the Dialysis Services of the state of São Paulo to the Adolfo Lutz Institute, during the performance of the State Monitoring Program. By using the isothermal boxes and the reusable ices, the obtained results indicated that the adopted system were able to guarantee the adequate temperature conditions during the transport from the sample collection point to the analytical laboratory.

Estabilidad de metabolitos del cannabis y cocaína en orina conservada a -20 °C en laboratorio de Armada (San Fernando), durante un periodo de tiempo superior a 1 año / Stability of cannabis metabolites and cocaine in urine preserved at -20ºC in Armada (San Fernando) laboratory over a period of time of more than 1 year

Antecedentes: El consumo de drogas constituye un problema en el medio militar, siendo el cannabis y la cocaína, las drogas ilegales con una mayor prevalencia de consumo. Los laboratorios situados en establecimientos farmacéuticos son los encargados de la realización del análisis preliminar de cribado de muestras, como lo marca la Instrucción Técnica 1/2012 de IGESAN, siendo confirmados los resultados positivos de estos, en el Instituto de Toxicología de la Defensa. Las muestras cuyos resultados sean positivos a drogas de abuso se conservarán durante seis meses (excepto Orden Judicial o expediente disciplinario en curso) a -20 °C, por si se requiere repetir la determinación. Los metabolitos presentes en la orina pueden deteriorarse durante su almacenamiento y conservación, obteniendo resultados distintos si reanalizamos la muestra. Así, es importante para el laboratorio conocer la estabilidad de los metabolitos presentes en dichas muestras. Objetivo: Estudiar la estabilidad de los metabolitos del cannabis y cocaína en orina, después de haber sido conservadas a -20 °C durante más de un ano. Material y métodos: 91 muestras de orina que resultaron positivas (65 a metabolitos del cannabis, 25 a metabolitos de cocaína y 1 a cannabis y cocaína), utilizando el analizador Cobas Integra 400 plusR (método semicuantitativo-cualitativo que usa una técnica inmunológica, con puntos de corte de 50 ng/ml para cannabis y 300 ng/ml para cocaína). Fueron conservadas en tubos de plástico a -20 °C durante mas de un ano. Tras descongelar y agitar suavemente para homogeneizarlas, se reanalizaron con el mismo analizador. Resultados: De los 66 muestras positivas a metabolitos de cannabis se produjo una disminución media respecto a los valores iniciales de -22,89% (rango +43,15 a -73,36). De las 26 muestras positivas a metabolitos de cocaína se produjo una disminución media respecto a los valores iniciales de -4,02% (rango de +7,03 a -49,01). Conclusiones: Observamos que los metabolitos del cannabis presentes en las orinas congeladas durante mas de un ano, disminuyen en mayor medida que los de la cocaina. Resultaron porcentajes similares a los obtenidos por otros autores en el caso de cannabis, aunque no asi en caso de cocaína (AU)

Antecedents: drug consumption constitutes a problem in the military milieu, being cannabis and cocaine the illegal drugs with a highest prevalence of consumption. Laboratories situated in pharmaceutical establishments are responsible for carrying out the preliminary analysis of screening samples, as it is shown by the I.T. 1/2012 of IGESAN, which confirmed the positive results of these in the Toxicology Institute of Defense. Samples whose results are positive to abused drugs would be kept for six months at -20 oC, if required by repeating the test. Metabolites which are present in urine could be deteriorated during storage and conservation, getting different results when the sample is revised. For laboratories it is important to know the stability of the metabolites present in the samples. Objective: to investigate cannabis and cocaine metabolite stabilities in urine, after having been kept at -20 oC for more than a year. Material and methods: 91 urine samples turned out positive (65 to cannabis, 25 to cocaine and 1 to both), using the analyzer Cobas Integra 400 plusR (semiquantitative-qualitative method using an immunological technique, with cutoffs of 50 ng/ml for cannabis and 300 ng/ml for cocaine). They were stored in plastic tubes at -20 °C for more than a year. After defrosting and shaking them softly to homogenize, they were reanalyzed with the same analyzer. Results: for the 66 positive samples of cannabis metabolites the average decrease from initial values was of -22, 89% (range -73.36% to +43.15%).For the 26 positive samples of cocaine metabolites the average decrease from initial values was of -4.02% (range -49.01% to +7.03%). Conclusions: It was reported that cannabis metabolites present in frozen urine for more than a year decreased to a greater extent than those of cocaine. Cannabis percentages were similar to those obtained by other authors, whereas this was not the case of cocaine metabolites (AU)

Manual de normas y procedimientos para la toma de muestras y su envío al Laboratorio Nacional de Salud / Manual of standards and procedures for taking samples and sending them to the National Health Laboratory

"Este manual tiene el objetivo de dar a conocer el procedimiento para la toma, almacenamiento y transporte de muestras al LNS así como los conceptos básicos de Bioseguridad. Es de utilidad para personal de laboratorio, enfermería, epidemiología, clínicos y otros que intervienen en este proceso." Incluye un correo electrónico y número telefónico para cualquier consulta en relación al tema. Contiene además, las definiciones de los conceptos relacionados al tema principal, además de la infraestructura que deberá tener el transporte de muestras, incluidos el equipo y el manejo de las mismas. Especifica procedimiento para la toma de muestras de varias enfermedades, entre ellas: Rotavirus, Enfermedad diarreica aguda de etiología bacteriana, Cólera, Fiebre Tifoidea, Hepatitis A, B o C, Dengue, Chikungunya, entre muchas más. En los anexos, incluye los códigos geográficos departamentales y municipales (como herramienta para la identificación de personas con VHI) También contiene en la sección de anexos, una lista de "Laboratorios que realizan cultivos de microbacterias" en el país. Además incluye "Fichas epidemiológicas" de distintas enfermedades

Utilidad del análisis modal de fallos y efectos para la detección de errores en el transporte de muestras al laboratorio clínico / Modal failure analysis and effects in the detection of errors in the transport of samples to the clinical laboratory

Objetivo. Debido a un descenso en la concentración del parámetro bioquímico glucosa en algunas muestras procedentes de los centros externos de extracción y el riesgo para la seguridad del paciente que supone, se decidió aplicar una adaptación de la herramienta «Análisis Modal de Fallos y Efectos Aplicada a los Servicios de Salud» (HFMEA) para la gestión del riesgo en la fase preanalítica del transporte de muestras desde centros externos al laboratorio clínico. Material y métodos. Estudio retrospectivo de los valores del parámetro bioquímico glucosa, durante 2 meses consecutivos. Análisis en sus diferentes fases: identificación del problema, formación de equipo, descripción gráfica del proceso, análisis de riesgos, diseño de la intervención e indicadores y responsables para la implementación. Resultados. Los resultados del parámetro glucosa en una de las rutas de transporte fueron significativamente inferiores (p = 0,006). Se analizaron los fallos y las causas potenciales de este problema. Se aplicaron criterios de criticidad y detectabilidad (puntuación ≥ 8) en el árbol de decisión y se decidió intervenir en: el desarrollo del sistema gestor documental, la reorganización de las extracciones en algunos centros y rutas de transporte, los acumuladores de frío de los contenedores de muestra, y el control de tiempos y temperaturas de transporte. Conclusiones. Para la etapa preanalítica, se proponen indicadores de calidad para el control de tiempo y temperatura de las muestras transportadas. La revisión periódica de determinados parámetros analíticos puede ayudar a detectar problemas en el transporte de muestras. La técnica HFMEA es de gran utilidad para el laboratorio clínico (AU)

Objective. Owing to the decrease in values of biochemical glucose parameter in some samples from external extraction centres, and the risk this implies to patient safety; it was decided to apply an adaptation of the «Health Services Failure Mode and Effects Analysis» (HFMEA) to manage risk during the pre-analytical phase of sample transportation from external centres to clinical laboratories. Materials and methods. A retrospective study of glucose parameter was conducted during two consecutive months. The analysis was performed in its different phases: to define the HFMEA topic, assemble the team, graphically describe the process, conduct a hazard analysis, design the intervention and indicators, and identify a person to be responsible for ensuring completion of each action. Results. The results of glucose parameter in one of the transport routes, were significantly lower (P = .006). The errors and potential causes of this problem were analysed, and criteria of criticality and detectability were applied (score ≥ 8) in the decision tree. It was decided to: develop a document management system; reorganise extractions and transport routes in some centres; quality control of the sample container ice-packs, and the time and temperature during transportation. Conclusions. This work proposes quality indicators for controlling time and temperature of transported samples in the pre-analytical phase. Periodic review of certain laboratory parameters can help to detect problems in transporting samples. The HFMEA technique is useful for the clinical laboratory (AU)

Estabilidad de 27 magnitudes bioquímicas en muestras de suero conservadas en refrigeración / Stability of 27 biochemical parameters in serum samples stored in the refrigerator

Introducción: Para asegurar la fiabilidad de los resultados de las magnitudes bioquímicas en muestras conservadas durante varios días, se aconseja realizar estudios de estabilidad según las condiciones de conservación empleadas. Con el presente estudio queremos conocer los límites de estabilidad de 27 magnitudes bioquímicas bajo las condiciones de conservación utilizadas en nuestro laboratorio. Material y métodos: Se recogieron 20 muestras de suero en tubos con gel separador y se conservaron a 4 ◦C. Las magnitudes bioquímicas se midieron 2 veces al día, con un intervalo de 6 h, durante 5 días. El cambio de concentración de las magnitudes a cada uno de los tiempos (Xt) respecto al valor inicial (X0) se expresó como cambio porcentual (Xt%) = (Xt/X0)*100 y se calculó la media de dicho cambio (Xmt%). La estabilidad se evaluó según 3 criterios. Criterio metrológico según la variación analítica interdía (CVa), por el que la Xmt% no podría superar al cambio significativo mínimo (CSM = ±1,65*CVa). Criterio biológico basado en la variación biológica intraindividual (CVb), por el que la Xmt% no podría superar al cambio significativo deseable (CSD = ±0,5*CVb). Y criterio combinado de ambos, por el que la Xmt% no podría superar el límite de cambio total (LCT = ± √ (1,65*CVa)2 + (0,5*CVb)2). Resultados: Veinte magnitudes se consideraron no estables según CSM y 14 según CSD. Al final del estudio, 9 magnitudes se consideraron no estables según el criterio LCT. Conclusión: Los criterios CSM y CSD resultan demasiados restrictivos. La combinación de ambos se ajusta más a las necesidades de nuestro laboratorio. Cada laboratorio debería estudiar la estabilidad de sus muestras con sus propias condiciones de conservación (AU)

Introduction: To ensure the reliability of the results of biochemical parameters in samples stored for several days, it is advisable to carry out stability studies according to the storage conditions employed. The limits of stability of 27 biochemical parameters under the storage conditions used in our laboratory were determined. Material and method: Twenty samples were collected in serum tubes with gel separator and stored at 4◦C. The biochemical parameters were measured twice daily at an interval of 6 h for5 days. The change in the concentration of parameters at each of the times (Xt) compared to the initial value (X0) was expressed as a percentage change (Xt%) = (Xt/X0)*100 and the mean percentage change (Xmt%) was calculated. The stability was evaluated according to 3 criteria. Metrology criteria according to within-day analytical variation (CVa), by which Xmt % could not exceed the minimum significant change (MSC = ±1.65*CVa). Biological criteria based on intra-individual biological variation (CVb), by which Xmt % could not exceed the desirable significant change (DSC = ±0.5*CVb). And the criteria based on the combination of both, by which Xmt % could not exceed the total limit of change (TLC = ±√ (1.65*CVa) 2+ (0.5*CVb)2). Results: The 20 parameters were considered stable according to MSC and 14 were according to DSC. In the end, nine parameters were considered stable according to the TLC criteria. Conclusion: MSC and DSC criteria are too restrictive. The TLC criteria is better suited to the needs of our laboratory. Each laboratory should investigate the stability of samples with their own storage conditions (AU)

Avaliação d qualidade do DNA obtido de amostras preservadas em parafina / Quality evaluation of DNA from samples preserved in parafin

A obtenção de um material genético íntegro e com concentrações satisfatórias para a amplificação de de uma determinada sequência são os principais desafios para o processamento de amostras de tecido preservados em parafina. O presente estudo teve como objetivo comparar três diferentes protocolos de extração de DNA que têm em comum entre si o princípio de extração por silica-gel. Vinte e sete amostras de tecidos tireoidianos preservados em parafina foram processadas por meio de cortes em triplicata de 20um. O método A utilizou tr~es horas na etapa de digestão do tecido, os métodos B e C utilizaram 16 horas para a digestão, sendo que o último utilizou diferentes solventes para reidratar o tecido e solução de fenol-clorofórmio-álcool isoamílico para purificação. Todos os métodos utilizaram em comum o conjunto de reagentes QIAamp DNA mini kit. Na comparação entre as concentrações obtidas de DNA, o método B spresentou maior média (3,7 ng/iL) já o método A obteve valor médio que 1,2 ng/uL e o método C, de 0,7 ng/uL. Todos os protocolos obtiveram valores da relação 260/280 e 260/230 fora dos valores de refer~encia esperado, evidenciando uma perda na qualidade do DNA extraído. O resultado da integridade do DNA, por meio de eletroforese em gel agarose também demonstrou o alto grau de degradação de todos os métodos analisados. Entretanto, foi possível realizar a genotipagem do polimorfismo 174G>C do gene da interleucina 6 em 100% das amostras testadas para o método C, e 66% par a o método A e B. O método C foi o mais reprodutivo para genotipagem , apesar do maior custo e tempo de processamento, sendo este método mais indicado para a implementação na rotina laboratorial de biologia molecular para amostras preservadas em parafina.

Recobrado de Shigella spp. conservada por la técnica de secado en perlas de vidrio / Recovery of Shigella spp. preserved on glass beads by dehydration technique

Introducción: la técnica de secado en perlas de vidrio se reporta como método de conservación microbiana desde hace varios años, pero la información existente es limitada. Con este antecedente, se decidió evaluar su utilidad para conservar bacterias, de origen clínico, en la colección de cultivos microbianos del Instituto Nacional de Higiene, Epidemiología y Microbiología. Métodos: se estudiaron dos cultivos de Shigella spp., mantenidas en refrigeración. Los datos de viabilidad obtenidos durante cuatro años de conservación fueron procesados con el paquete estadístico SPSS versión 15.0. El análisis estadístico incluyó el de la varianza para la comparación de las medias del recobrado de células viables para las variables tiempo de conservación, dilución y mezcla preservante, y el test de Scheffé de comparaciones múltiples post hoc para la discriminación de las medias. Fueron controladas las características fisiológicas y la respuesta a la tinción de Gram de las cepas. Resultados: no se encontraron diferencias significativas entre las mezclas preservantes utilizadas en este ensayo, y pudieron recobrarse ambas cepas durante los cuatro años de estudio. A partir de los seis meses se apreció una disminución del efecto protector en todas las mezclas. Se obtuvo variabilidad en algunos caracteres fisiológicos (indol, dulcitol y manitol), pero no para la respuesta a la tinción de Gram en ambas cepas, la que se mantuvo estable. Conclusiones:: el método resultó apropiado para mantener Shigella spp. por tiempo limitado, pero pudiera utilizarse como alternativa de conservación en laboratorios con limitados recursos a corto plazo, por su sencillez, bajo costo y efectividad, y debe garantizarse la disponibilidad de réplicas por otras técnicas(AU)

Introduction: glass bead dehydration technique has been reported as a microbial preservation method for some years, but the available information is limited. Based on this antecedent, it was decided to evaluate its usefulness to preserve bacteria of clinical origin in the collection of microbial cultures at the National Institute of Hygiene, Epidemiology and Microbiology. Methods: a study was conducted of two Shigella spp. cultures kept under refrigeration. The viability datas obtained during four years of preservation were processed with the statistical package SPSS, version 15.0. Statistical processing included analysis of variance for comparison of the mean recovery values of viable cells for the variables preservation time, dilution and preserving mix, and Scheffe's test of post hoc multiple comparisons for means discrimination. Physiological characteristics were controlled, as well as the response of strains to Gram stain. Results: no significant differences were found between the preserving mixes used in the trial, and both strains could be recovered during the four years of the study. The protective effect of all mixes was found to decrease after six months. Variability was obtained for some physiological characters (indol, dulcitol and mannitol), but response to Gram stain remained stable in both strains. Conclusions:: the method was found to be suitable to preserve Shigella spp. for a limited time, but it could be used as a short-term preservation alternative in laboratories with few resources, due to its simplicity, low cost and effectiveness. Availability should be ensured of replicas obtained by other techniques(AU)

Recobrado de Shigella spp. conservada por la técnica de secado en perlas de vidrio / Recovery of Shigella spp. preserved on glass beads by dehydration technique

Introducción: la técnica de secado en perlas de vidrio se reporta como método de conservación microbiana desde hace varios años, pero la información existente es limitada. Con este antecedente, se decidió evaluar su utilidad para conservar bacterias, de origen clínico, en la colección de cultivos microbianos del Instituto Nacional de Higiene, Epidemiología y Microbiología. Métodos: se estudiaron dos cultivos de Shigella spp., mantenidas en refrigeración. Los datos de viabilidad obtenidos durante cuatro años de conservación fueron procesados con el paquete estadístico SPSS versión 15.0. El análisis estadístico incluyó el de la varianza para la comparación de las medias del recobrado de células viables para las variables tiempo de conservación, dilución y mezcla preservante, y el test de Scheffé de comparaciones múltiples post hoc para la discriminación de las medias. Fueron controladas las características fisiológicas y la respuesta a la tinción de Gram de las cepas. Resultados: no se encontraron diferencias significativas entre las mezclas preservantes utilizadas en este ensayo, y pudieron recobrarse ambas cepas durante los cuatro años de estudio. A partir de los seis meses se apreció una disminución del efecto protector en todas las mezclas. Se obtuvo variabilidad en algunos caracteres fisiológicos (indol, dulcitol y manitol), pero no para la respuesta a la tinción de Gram en ambas cepas, la que se mantuvo estable. Conclusiones:: el método resultó apropiado para mantener Shigella spp. por tiempo limitado, pero pudiera utilizarse como alternativa de conservación en laboratorios con limitados recursos a corto plazo, por su sencillez, bajo costo y efectividad, y debe garantizarse la disponibilidad de réplicas por otras técnicas

Introduction: glass bead dehydration technique has been reported as a microbial preservation method for some years, but the available information is limited. Based on this antecedent, it was decided to evaluate its usefulness to preserve bacteria of clinical origin in the collection of microbial cultures at the National Institute of Hygiene, Epidemiology and Microbiology. Methods: a study was conducted of two Shigella spp. cultures kept under refrigeration. The viability datas obtained during four years of preservation were processed with the statistical package SPSS, version 15.0. Statistical processing included analysis of variance for comparison of the mean recovery values of viable cells for the variables preservation time, dilution and preserving mix, and Scheffe's test of post hoc multiple comparisons for means discrimination. Physiological characteristics were controlled, as well as the response of strains to Gram stain. Results: no significant differences were found between the preserving mixes used in the trial, and both strains could be recovered during the four years of the study. The protective effect of all mixes was found to decrease after six months. Variability was obtained for some physiological characters (indol, dulcitol and mannitol), but response to Gram stain remained stable in both strains. Conclusions:: the method was found to be suitable to preserve Shigella spp. for a limited time, but it could be used as a short-term preservation alternative in laboratories with few resources, due to its simplicity, low cost and effectiveness. Availability should be ensured of replicas obtained by other techniques

Estudio de dos sistemas de transporte para mantener la viabilidad de bacterias de interés clínico / Study of the ability of two swab transport systems to maintain viability of clinically important bacteria / Estudo de dois sistemas de transporte para manter a viabilidade de bactérias de interesse clínico

Se compararon dos dispositivos de conservación de muestras tomadas por hisopado con cepas de referencia de Streptococcus pyogenes, Haemophilus influenzae, Neisseria gonorrhoeae y Streptococcus pneumoniae (ambos con medio de Stuart). El dispositivo Copan Venturi Transystem® (Copan Italia Spa, Brescia, Italia) resultó ser significativamente más efectivo que el Eurotubo (Deltalab, Rubí, Barcelona, España) probablemente porque la estrangulación que presenta al comienzo de la columna semisólida (sistema tipo Venturi) permitiría una mejor conservación de los microorganismos.

Two extendedly-used swab transport devices with Stuart medium using Streptococcus pyogenes, Haemophilus influenzae, Neisseria gonorrhoeae and Streptococcus pneumoniae reference strains, were compared. Copan Venturi Transystem® (Copan Italia Spa, Brescia, Italy) was significantly more effective than Eurotubo (Deltalab, Rubí, Barcelona, Spain), probably because the narrowing of the tube, just at the beginning of the semisolid column (Venturi system), would yield a better conservation of diffrerent organisms.

Foram comparados dois dispositivos de conservação de amostras tomadas por swab com cepas de referência de Streptococcus pyogenes, Haemophilus influenzae, Neisseria gonorrhoeae e Streptococcus pneumoniae (ambos com meio de Stuart). O dispositivo Copan Venturi Transystem® (Copan Italia Spa, Brescia, Itália) resultou ser significativamente mais efetivo que o Eurotubo (Deltalab, Rubí, Barcelona, Espanha) provavelmente porque o estrangulamento que apresenta no início da coluna semi-sólida (sistema tipo Venturi) permitiria uma melhor conservação dos microorganismos.

Estudios de nuevas tecnicas para conservación de piezas anatómicas / Study of new techniques for the preservation of anatomical pieces: plastination

Introducción: la conservación de las piezas cadavéricasen formol con fines docentes ha sido y lo es en la actualidaduna preocupación compartida por los docentes de la Facultadde Ciencias Médicas.Objetivos: eliminar los riesgos sanitarios; mejorar lacalidad del material; obtener piezas anatómicas que conservensu flexibilidad; favorecer el contacto directo de los estudiantescon las estructuras a estudiar; mejorar la calidad de las piezasanatómicas del Museo Anatómico Pedro Ara.Material y métodos: se trabajó en material cadavéricoanimal, con estructuras pequeñas que facilitan la aplicaciónde la técnica de impregnación en silicona de especímenesenteros o cortes, obteniendo apariencia natural de preparadoselásticos y flexibles.Resultados: se obtuvo piezas con elasticidad, flexibilidady conservación de la coloración. Permitió realizar preparadossin uso de formalina.Conclusión: afirmamos que la plastinación permiteconservar y manipular estructuras anatómicas con seguridad,sin necesidad de utilizar formol u otro elemento tóxico

Introduction: Formaldehyde preservation of body parts for study purposes has alwaysbeen a concern shared by teachers at the School of Medicine.Objectives: To eliminate health risks; improve the quality of samples; obtain anatomicalpieces which keep flexibility; help students’ direct contact with the structures to be studied;and to improve the quality of anatomical pieces at the Anatomical Museum Pedro Ara.Material and methods: We worked on cadaverous animal material with small structuresthat facilitate the application of the technique of silicon impregnation of complete orsectioned specimens obtaining elastic and flexible preparations with natural appearance.Results: We obtained elastic flexible pieces with color conservation. It was possible toprepare samples without formalin.Conclusion: We assert that plastination allows the safe preservation and manipulationof anatomical structures, with no need to use formaldehyde or other toxic element

Análisis de resultados del Programa Externo de Control de Calidad SEIMC. Año 2010 / Analysis of the results of the 2010 External Quality Control Program of the Spanish Society of Infectious Diseases and Clinical Microbiology

El Programa de Control Externo de Calidad de la Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica (SEIMC) incluye las áreas de bacteriología, serología, micología, parasitología, micobacterias, virología y microbiología molecular. En este manuscrito se presenta el análisis de los resultados enviados por los participantes en los controles remitidos durante el año 2010. Los resultados obtenidos confirman de nuevo la buena capacitación general de los laboratorios españoles de microbiología clínica de años anteriores. A pesar de ello, el programa muestra que es posible obtener un resultado erróneo, incluso en determinaciones de gran trascendencia y en cualquier laboratorio. Resaltamos la importancia de complementar el control interno que cada laboratorio lleva a cabo con estudios de intercomparación externos, como los que ofrece el Programa SEIMC (AU)

The External Quality Control Program of the Spanish Society of Infectious Diseases and Clinical Microbiology includes controls for bacteriology, serology, mycology, parasitology, mycobacteria, virology and molecularmicrobiology. This article presents the most important conclusions and lessons of the 2010 controls. As awhole, the results obtained in 2010 confirm the excellent skill and good technical standards found inprevious years. However, erroneous results can be obtained in any laboratory and in clinically relevant determinations. The results of this program highlight the need to implement both internal and externalcontrols to ensure maximal quality of microbiological tests (AU)

Biobancos, laboratorios clínicos e investigación biomédica / Biobanks, clinical laboratorios and biomedical research

Los biobancos son instituciones públicas o privadas sin ánimo de lucro dedicadas a la recogida, el procesamiento, el almacenamiento y la distribución de especímenes biológicos humanos, junto a los datos asociados con esas muestras. El Instituto de Salud Carlos III ha creado y financiado una red de biobancos hospitalarios cuya finalidad es el almacenamiento de muestras para investigación. Esta red de biobancos pretende integrarse en la Red Europea de Infraestructuras en Biobancos y Recursos Moleculares (BBMR), cuyo objetivo es favorecer la realización de estudios en gran escala. Se revisan los principales aspectos, tanto organizativos, como operativos de los biobancos y su relación con los laboratorios clínicos y la investigación biomédica (AU)

Biobanks are non-profit public or private institutions for the collection, processing, storage and distribution of human biological specimens, linked to associated data of those samples. The Instituto de Salud Carlos III has set up and funded a hospital biobank network focused on the storage of samples for research. This network is expected to integrate into the Biobanking and Biomolecular Resources Research Infrastructure (BBMR) whose objective is to favour large-scale studies. The main organisational and operational aspects of biobanks are reviewed as well as their relationship with clinical laboratories and biomedical research (AU)

Estudios seroepidemiológicos / Seroepidemiologic studies

Los estudios seroepidemiológicos permiten estudiar la distribuciónde las enfermedades de manera indirecta, mediantela detección sérica de marcadores de infección y de inmunidad.Estos estudios son aplicables en investigaciones en saludpública, investigaciones destinadas a determinar la prevalenciao incidencia de ciertas infecciones en particular, para evaluarprogramas de control e inmunización y para evaluar antecedenteshistóricos cuando un nuevo microorganismo es descubierto.En el campo de las vacunas los estudios seroepidemiológicostienen dos objetivos fundamentales: El estudio de la epidemiologíade la infección y de la inmunidad protectora en lasenfermedades vacunales o inmunoprevenibles, y la planificacióny la evaluación de los programas de vacunaciones.Para la buena calidad de los estudios seroepidemiológicoses importante que la muestra de sueros utilizada sea representativade la población total que queramos estudiar, y se debetener en cuenta que la prueba serológica a utilizar debe teneruna elevada sensibilidad(AU)

Serological studies allow us to study diseases distributionby an indirect way, trough serological detection of infectionand immunity markers. These studies are applied in publichealth research,in studies to infections, to evaluate control andimmunization programs and to evaluate historical backgroundwhen a new microorganism is found.In the vaccines field, epidemiological studies present twomain objectives: The study of the epidemiology of theinfection and the study of the protective immunity invaccinable or immuno preventable diseases, and planning andevaluation of vaccine programs.For the good quality of epidemiological studies isimportant to use serum samples which are representative of thetotal population under study, and to take into account that theserological tests used have to show a high sensitivity(AU)